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La FCE cuenta con 10 carreras de Posgrado con modalidad presencial, 3 carreras de Posgrado con modalidad a distancia y 5 carreras de Posgrado compartidas con otras Unidades Académicas con modalidad presencial. Además ofrece diversos cursos enmarcados en carreras de posgrado.
10 carreras de Posgrado con modalidad presencial
- Doctorado en Administración Pública
- Maestría en Administración de Empresas
- Maestría en Administración y Finanzas
- Maestría en Administración Pública
- Maestría en Contabilidad y Auditoría
- Maestría en Economía Aplicada
- Especialización en Contabilidad y Auditoría para PyMEs
- Especialización en Costos y Gestión Empresarial
- Especialización en Sindicatura Concursal
- Especialización en Tributación
3 carreras de Posgrado modalidad a distancia
- Maestría en Responsabilidad Social Organizacional
- Especialización en Costos y Gestión Empresarial
- Especialización en Dirección y Gestión de Organizaciones Públicas
5 carreras de Posgrado compartidas con otras Unidades Académicas modalidad presencial
- Doctorado en Estudios Sociales (Carrera conjunta entre Facultad de Humanidades y Ciencias, Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales y Facultad de Ciencias Económicas de la Universidad Nacional del Litoral)
- Maestría en Negocios Agroalimentarios (Carrera conjunta entre las Facultades de Ciencias Económicas y de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional del Litoral)
- Maestría en Gestión Ambiental (Carrera compartida con todas las Facultades de la UNL, el Instituto de Desarrollo Tecnológico para la Industria Química (INTEC) y el Instituto Nacional de Limnología – INALI)
- Maestría en Desarrollo y Políticas Públicas (Propuesta académica impulsada por la Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales, de Humanidades y Ciencias y de Ciencias Económicas de la Universidad Nacional del Litoral)
- Especialización en Gestión y Vinculación Tecnológica (Carrera compartida con diez Unidades Académicas de la UNL, con sede administrativa en la Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas de la UNL)