La FCE cuenta con: 

2 carreras de Pregrado con modalidad a distancia

Tecnicatura en Administración y Gestión Pública

Tecnicatura Universitaria en Control y Auditoría Gubernamental

3 carreras de Grado con modalidad presencial

Contador Público Nacional

Licenciatura en Administración

Licenciarura en Economía

9 carreras de Posgrado con modalidad presencial

Doctorado en Administración Pública

Maestría en Administración de Empresas

Maestría en Administración y Finanzas

Maestría en Administración Pública

Maestría en Economía Aplicada

Especialización en Contabilidad y Auditoría para PyMEs

Especialización en Costos y Gestión Empresarial 

Especialización en Sindicatura Concursal

Especialización en Tributación

2 carreras de Posgrado con modalidad a distancia 

Especialización en Costos y Gestión Empresarial

Especialización en Dirección y Gestión de Organizaciones Públicas

5 carreras de Posgrado compartidas con otras Unidades Académicas con modalidad presencial

Doctorado en Estudios Sociales (Carrera conjunta entre Facultad de Humanidades y Ciencias, Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales y Facultad de Ciencias Económicas de la Universidad Nacional del Litoral)

Maestría en Desarrollo y Políticas Públicas (Propuesta académica impulsada por la Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales, de Humanidades y Ciencias y de Ciencias Económicas de la Universidad Nacional del Litoral)

Maestría en Gestión Ambiental (Carrera compartida con todas las Facultades de la UNL, el Instituto de Desarrollo Tecnológico para la Industria Química (INTEC) y el Instituto Nacional de Limnología – INALI)

Maestría en Negocios Agroalimentarios (Carrera conjunta entre las Facultades de Ciencias Económicas y de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional del Litoral)

Especialización en Gestión y Vinculación Tecnológica (Carrera compartida con diez Unidades Académicas de la UNL, con sede administrativa en la Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas de la UNL)